Avdelingens hovedkunde er Diakonhjemmet sykehus. Andre kunder er private sykehus, sykehjem og hjemmebaserte tjenester som tilhører Diakonhjemmet sykehus' sektor.
Avdelingen leverer legemidler og apotekvarer. En annen viktig oppgave er å gi informasjon om legemidler og besvare spørsmål fra helsepersonell.
De fleste poster på Diakonhjemmet sykehus har ASL (Apotekstyrt legemiddellager). Sykehusapoteket har ansvar for legemiddellagrene og fyller opp etter en basisliste. Basislisten inneholder en oversikt over de legemidlene som alltid skal være på lager på posten med minimums- og maksimumsmengder. Hovedhensikten er å kvalitetssikre legemiddelhåndteringen, spare sykepleiertid og redusere legemidler som kastes.
Avdelingsleder er medlem av sykehusets legemiddelkomite og er sykehusets LIS-kontakt. LIS er ansvarlig for anbudsprosessen for legemidler, ernæringspreparater og væsker. De fleste av landets sykehus er med i LIS.